多年來，厄立特里亞政府在沒有正式起訴和審訊的情況下，逮捕和監禁耶和華見證人，包括婦女和老人。這些耶和華見證人因為參與宗教活動或一些不明的原因而被監禁。在1993年，耶和華見證人沒有參與獨立公投，並因為良心的緣故而拒絕服兵役，因此總統阿費沃爾基在1994年10月25日頒布法令，撤銷他們的公民身分。在實施徵兵制之前，厄立特里亞政府容許人選擇替代役。當時，不少耶和華見證人在不同的政府部門服替代役。當局會為完成這種服務的人頒發正式的證書，並且常常對他們的貢獻作出肯定。可是，阿費沃爾基總統頒布法令後，安全部門根據這項法令監禁、虐待和騷擾耶和華見證人，企圖迫使他們放棄信仰。

目前，有64名耶和華見證人仍被監禁（34名男子和30名女子）。2020年12月4日，28名耶和華見證人（26名男子和2名女子）獲釋。在此之前，他們因信仰緣故，被囚禁了5至26年不等。2021年1月29日，又1名耶和華見證人男子在被囚超過12年後獲釋。2021年2月1日，當局又釋放3名耶和華見證人（1名男子和2名女子），這3人被囚禁4到9年不等。

厄立特里亞至今有四名耶和華見證人在監獄中死亡，有三名年長的耶和華見證人曾被拘留在環境惡劣的地方，結果在獲釋後死去。

2018年，有兩名耶和華見證人被轉送到邁賽瓦監獄後死去。哈布特米蓋爾·特斯法馬里亞姆於2018年1月3日去世，終年76歲。另一位是哈布特米蓋爾·梅荷恩，他於2018年3月6日去世，終年77歲。他們在2008年未經起訴就被監禁。

在2011年和2012年，有兩名耶和華見證人因在梅特爾監獄受到不人道的對待而死去。米斯金納·蓋布拉廷薩被關在一個稱為「地下室」的懲罰囚犯的地方，在那裡經歷極度的炎熱，結果在2011年7月死去，終年62歲。約翰那斯·海爾被關在一個類似的牢房裡將近4年，最後於2012年8月16日去世，終年68歲。三名年長的耶和華見證人，卡赫賽·梅科內、喬托莫·加布雷里西托斯以及澤哈耶·特斯法里亞姆，因被拘禁在環境惡劣的梅特爾監獄裡，在獲釋後去世。

厄立特里亞一直無視國際人權標準。一些主要的人權機構譴責厄立特里亞侵犯基本人權，並不斷敦促他們要糾正問題。

2014年，人權理事會收到厄立特里亞人權特別報告員的報告。這份報告促請該國「依國際常規」，尊重依良心拒服兵役的權利，也要「保障所有囚犯的人身安全；確保有需要者獲得醫藥治療」，並「依國際標準改善拘留條件」。在2015年的決議裡，人權理事會要求厄立特里亞政府容許人民「出於良心拒服兵役」。

2016年，由人權理事會成立的厄立特里亞人權調查委員會指出，厄立特里亞犯下「危害人類罪」，因為該國「以宗教和族裔」為理由，迫害耶和華見證人和其他人。

2017年，非洲兒童權利與福利問題專家委員會在報告中指出，雖然厄立特里亞訂立法律保護兒童的權利，「但耶和華見證人的兒童」並不能享有這些權利，而且遭受惡劣的對待。該委員會對這個問題表示關注，並建議厄立特里亞要承認和全面保障所有兒童的「思想、良心和宗教信仰自由的權利」。

2018年，非洲人權和民族權委員會建議厄立特里亞「要採取緊急措施，保障包括耶和華見證人在內的被拘禁人士的基本權利」，並要求當局調查耶和華見證人在拘留時死亡的事件。該委員會也強調厄立特里亞不應該剝奪耶和華見證人擁有「公民身分」的權利。

2019年5月，聯合國人權事務委員會敦促厄立特里亞作出保證，容許人民行使宗教和信仰自由，並「釋放所有因行使宗教自由而遭到逮捕或拘留的人，包括耶和華見證人」。該委員會也要求厄立特里亞要「確保在法律上承認出於良心拒服兵役，並為出於良心拒服兵役者提供民事性質的替代服務」。

在一份為期2021年5月12日的報告中，聯合國特別報告員呼籲厄立特里亞政府「立即並無條件釋放那些未經過審判、因信仰被監禁的人，其中也包括20名耶和華見證人」，也呼籲厄立特里亞政府不要因為耶和華見證人的信仰就剝奪他們的公民權。厄立特里亞政府該「按照非洲人權和人民權利委員會的建議，讓耶和華見證人繼續享有公民權，並調查在被囚期間去世的耶和華見證人的死因」。

大部分被監禁的耶和華見證人男子都被無限期的囚禁，除非瀕臨死亡或已死去，否則不可能離開監獄。由於該國的法律制度沒有為他們提供有效的申訴途徑，因此一旦入獄就等同終身監禁。

1. 2024年10月17日

   共有64位耶和華見證人被監禁。

2. 2021年2月1日

   3位耶和華見證人獲釋。

3. 2021年1月29日

   1位耶和華見證人獲釋。

4. 2020年12月4日

   28位耶和華見證人獲釋。

5. 2018年3月6日

   哈布特米蓋爾·梅荷恩在轉移到邁賽瓦監獄後去世，終年77歲。

6. 2018年1月3日

   哈布特米蓋爾·特斯法馬里亞姆在轉移到邁賽瓦監獄後去世，終年76歲。

7. 2017年7月

   所有被囚禁在梅特爾監獄裡的耶和華見證人都被轉移到阿斯馬拉市外的邁賽瓦監獄。

8. 2014年7月25日

   在4月14日被逮捕的人中大部分已被釋放，但在4月27日被逮捕的人中有20人仍被拘禁。

9. 2014年4月27日

   有31名耶和華見證人被逮捕，當時他們正聚集在一起學習聖經。

10. 2014年4月14日

    有90多名耶和華見證人被逮捕，當時他們正舉行一年一度的耶穌受難紀念聚會。

11. 2012年8月16日

    約翰那斯·海爾在環境極端惡劣的牢房中死去，終年68歲。

12. 2011年7月

    米斯金納·蓋布拉廷薩在環境極端惡劣的牢房中死去，終年62歲。

13. 2009年6月28日

    政府突擊搜查一名耶和華見證人的家，逮捕所有在場參加宗教聚會的23人，當中最小的只有2歲，最年長的有80歲。

14. 2009年4月28日

    除了一個耶和華見證人，當局把其他拘留在警察局的耶和華見證人轉押到梅特爾監獄。

15. 2008年7月8日

    政府開始突擊搜查民宅和工作的地方，拘捕了24個耶和華見證人，他們大部分都是家庭的經濟支柱。

16. 2002年5月

    政府只認可四個宗教，其餘宗教團體一律被取締。

17. 1994年10月25日

    總統下令撤銷耶和華見證人的公民身分，也剝奪他們的基本公民權利。

18. 1994年9月17日

    波洛·伊亞蘇、以撒·莫戈、尼格德·特克勒馬里亞姆都沒有經過正式起訴和審訊就被監禁。

19. 20世紀50年代

    厄立特里亞開始有耶和華見證人。