Der har været Jehovas Vidner i Sydkorea i mere end 100 år, og de har haft mulighed for frit at udøve deres tro. Den eneste betydelige udfordring Jehovas Vidner i Sydkorea står over for, er regeringens ubarmhjertige retsforfølgelse af dem der nægter at udføre militærtjeneste af samvittighedsgrunde.

Sydkorea anerkender ikke retten til samvittighedsnægtelse og har ikke en lovgivning der tillader alternativ civil tjeneste. Derfor bliver unge mænd blandt Jehovas Vidner, der er samvittighedsnægtere, typisk idømt 18 måneders fængsel. Mellem 40 og 50 mænd der er Jehovas Vidner, bliver sat i fængsel hver måned. Efter at samvittighedsnægterne er blevet løsladt fra fængslet, lider de stadig under at have en plettet straffeattest og ser ud til at have undveget militærtjeneste. Et Jehovas Vidne kan derfor være begrænset i valg af arbejde og stå over for forskellige vanskeligheder i sociale forhold.

Der er også problemer for mænd der har fuldført den tvungne militærtjeneste men senere har lært at følge det Bibelen siger om at elske deres næste og ikke lære at føre krig. Mens de stadig kan blive indkaldt til reserven, bliver disse mænd udsat for gentagne anklager og pålagt bøder fordi de nægter fortsat militærtræning.

FN’s Menneskerettighedskomité har afsagt over 500 kendelser mod Sydkorea for overtrædelse af retten til at nægte militærtjeneste af samvittighedsgrunde, og den betragter de fængslinger Sydkorea foretager, som “vilkårlige”. Den har også erklæret at Sydkorea er “forpligtet til at undgå lignende overtrædelser” i fremtiden. Hvis dette problem blev løst, ville det betyde ægte respekt for samvittigheds- og religionsfriheden i Sydkorea.